Двадцать восемь лет неизменно руководит он этой сетью, в которой работает целая армия хинизаторов, бонификаторов и врачей-маляриологов. Несколько раз в год объезжает он эти станции. Теперь он уже не кажется, как это было в первые годы его работы, героем-юношей, одиноко несущимся в ладье про­ тив бурного течения необозримой стихии. Он - опытный и самый авторитетный во всей Средней Азии руководитель многочисленных противомалярийных работников. Исаев первый постиг тайны водных стихий Средней Азии. Он заинтересовался режимом рек. Он вторгся в область неведомой ему науки и решил проблему борьбы с водной стихией. Экономика сельского хозяйства Средней Азии в силу почвенных и климатических условий испокон веков в значительной степени была связана с водой, поливными культурами (хлопок, рис). Посевам нужна была вода, но никто в прошлом не думал о совершенстве оросительных систем. В царской России они строились по туземному типу, стихийно. В результате происходило колоссальное обводнение и заболачивание огромных площадей, в астрономических количествах размножался малярийный комар, стихийно росла малярия.

Плохо поддающееся регуляции головное оросительное сооружение туземного типа возле Ташкента (1926). Между тем схема инженерной оросительной системы проста и совершенна. В построении этой системы основную роль играет головное ирригационное сооружение. Оно пред­ставляет собой щит, регулирующий поступление воды в отводимый от реки оросительный канал. Задача этого сооружения проста: оно не должно допускать переполнения канала при паводках; при низком же уровне воды в реке оно в сочетании с плотиной, перегораживающей реку несколько ниже, обеспечивает подачу воды в канал. Туземные системы отличались либо отсутствием головных сооружений, либо представляли собой кустарные запруды, которые во время паводков прорывались и вызывали обводнение и заболачивание низин. Оросительные каналы подают воду для орошения полей. Это - распределительная сеть. Обратный отвод «отработан ой» воды с полей осуществляется через сбросную сеть и дренажи.

Схема распределительной и оросительной сети - это схема реки с притоками в обратном направлении (вспять), схема же сбросной сети - это схема реки с притоками, так как обычно сбросные воды опять спускаются ниже по течению в реку. Исаев изучил паводки среднеазиатских рек. Теперь стало известно, когда можно ждать особой активности малярийного комара. Он выяснил, что весенние паводки связаны с таянием снегов в предгорьях, а летние - зависят от таяния высокогорных ледников. Первые не играют столь важной роли в заболачивании республики, вторые же ведут к заболачиванию обширных площадей. Были точно нанесены на карту заболачиваемые массивы. Исаев обратил внимание, что грозные эпидемии малярии возникают в Средней Азии периодически - каждые 10-12 лет. Он разгадал причину этого: водные ресурсы в виде ледников там, в горах, накапливаются постепенно, в течение 10-12 лет.